经过与一十一（神木隆之介 饰）的恶战，濑文焚流（加濑亮 饰）身受重伤，命几不保。在此期间，青池里子（栗山千明 饰）随女儿小润（森山树 饰）悄然离开医院；而各国政要的一次关于简单计划的秘密会议上，自称卑弥呼的日本代表抹杀所有人，他代表SPEC持有者正式向普通人类宣战。世态险恶的当下，濑文急急出院，和当麻纱绫（户田惠梨香 饰）一同调查青池母女的行踪。而野野村组长（龙雷太 饰）则独自行动，查找简单计划病毒疫苗的下落。新的SPEC持有者交替登场，残酷的杀戮却从未停止。关于前人类的秘密昭然若揭，惨烈浩大的人种战争即将拉开序幕…… 本片为SPEC系列完结篇的前篇。
本片基于艾米·利普罗特所著回忆录，她和芬沙伊德改编剧本，讲述刚从康复中心出来的罗娜在离开十多年后，回到了苏格兰的奥克尼群岛，回到童年时的牧羊场，再度体会到了自然之美和静谧的珍贵。
检察官久力生公平（木村拓哉 饰）六年后回到东京地方监察厅城西部，继续由事务官雨宫舞（松隆子 饰）担任助手。六年时间并没有隔断他们的感情，在斗嘴中舞试探着久利生的心意，久利生感觉到却故意调皮地置之不理。芝山检察官（阿部宽 饰）正对一桩故意伤害人的案件提起起诉，犯罪嫌疑人对罪状也供认不讳。芝山由于正在为自己争取女儿抚养权的官司弄得焦头烂额，这件官司只得转交久利生处理。久利生和舞去了案发现场重演经过时遇见了一个神情庄重的中年人。在初审法庭上发现他竟是犯罪嫌疑人的辩护律师——在业界首屈一指的蒲生一臣，而犯罪嫌疑人也一改之前的口供，否认罪状。原来花岗练三郎议员正在被控贿赂，而他坚称当时正在牙医诊所，目击证人正是一名保安，这名保安就是久利生的犯罪嫌疑人。为了帮花岗脱罪，所以这名犯罪嫌疑人必须身在牙医诊所而不是案发现场。 对于高官来说，让花岗入罪是为民除害。但是对于久利生来说，没有什么比杀人之后逃窜更恶劣。尽管艰难重重，他们还是坚定地踏上了寻找证据控告入罪之路。
菲利克斯（威廉·霍尔登 William Holden 饰）是一名电影制片人，他倾尽所有拍摄了高成本的影片《夜风》，但首映式之后却收获了恶评如潮，不仅如此，他在片中担任女主角的妻子（朱莉·安德鲁斯 Julie Andrews 饰）亦离他而去，绝望之中，菲利克斯决定自我了断。 幸运的是，一个同事发现了菲利克斯的自杀念头，救下了他，为了帮助菲利克斯走出抑郁，同事和制片商们在菲利克斯家里举行了一场惹恼的派对，在此过程中，菲利克斯被激发了灵感，决定拍一部色情片，并且依旧是请自己的妻子出演女主角，这回真的是背水一战了。
