1897年，大韩帝国时代动荡混沌，时有不同罪案发生，别巡检调查队四出调查，找寻破案的线索。 别巡检第2季的时代背景为1897年大韩帝国的国号宣布之后，比第1季还要迟些。高宗自俄罗斯回国后自称为皇帝，由此朝鲜便变为帝国，以阐明国家的自主性和独立性。并且施行了财政、教育、军事等几乎全方位的光武改革，令朝鲜向现代化迈进了一大步。因此这个时期应该是比第1季更为激动人心的时期，然而大韩帝国所追求的新价值，让国民看到的却是比任何时候都强大的同一与自主的混乱。
大年三十夜，李继田要求儿女出资兴建家庭股份制农场，引发李家上下轩然大波。二儿子绍勇极力赞同，招弟希望丈夫随自己进城发展，夫妻关系出现裂痕。小女儿绍华为支持娘家办场，怂恿丈夫从婆家“骗”出资金，不想为自己婚姻埋下危机。大哥绍刚甘心让权，大嫂王爱春望夫成龙，不得已频出“恶”招。绍勇苦于自己的梦想无人理解，却意外得到了初恋情人吴秋玲的支持，事业上的惺惺相惜使两人遭遇来自各方的误会。李继田与吴老二同时钟情村医桂兰，李吴两家由于家庭农场和情感危机演变得势同水火。农场的壮大一波三折，招弟最终理解了绍勇的坚持，秋玲与招弟哥哥招彬也收获了他们的幸福。农场丰收使村民受益，年夜里绍勇宣布按股分红让一家人喜气洋洋。
比尔·普尔曼继续饰演警探Harry Ambrose，他回到了纽约郊区的家乡，对一桩令人不安的、令人痛心的犯罪事件进行调查——一个11岁男孩杀死了他的父母，没有明显的动机。Ambrose意识到这个男孩并不寻常，来历也很可疑，他被卷入了家乡的黑暗面中，与那些不惜一切保护秘密的人对抗，一个神秘的女儿被证实是这个复杂拼图的一部分。库恩饰演Vera，一个难以对付、神秘的女人，她在维护社会理想和满足自己的欲望之间挣扎。
