本作是为了纪念在1996年起开始的《游戏王》系列漫画连载二十周年所推出的动画电影。在跨越无数的试练后，武藤游戏与身体内的另一人格“暗游戏”进行最终决战并获胜，在作出正式诀别后踏上各自的旅途。在经历一段时间后，游戏等人重新回归平凡的生活。然而，一名自称蓝神的神秘少年却出现在他们的眼前。另一方面，将暗游戏视为劲敌的海马濑人，在暗游戏消失的地方发掘“千年积木”并打算将其重新完成，试图再度复活暗游戏。
阿东在准备店铺早点的时候，结识了萌萌和樊儿两姐妹，在招待两姐妹的时候被大胃王樊儿吃光了所有的早点。正要催促二人离开时，却跟一碗被仇家追打的牛肉面相遇，萌萌两人帮助解围后，牛肉面却消失了踪影。
三桥晴子的看护对象高泽喜十郎，被寺田卓送去成为由第6世代电脑控制的高性能看护床“Z-001”实验对象。为了救出喜十郎，晴子在骇客老人的帮助下利用喜十郎亡妻高泽春的声音来唤醒喜十郎，电脑却因此产生春的人格而开始失控。
（少儿版） 旋风岛是一个特殊的岛屿，岛屿上春夏秋冬同时存在。坐落于春岛的旋风村是个宁静和平的小村庄，突然有一天，旋风村的村长接到了一封邀请他前往夏岛参加旋风岛村长大会的邀请函。村长复命参加，在途中他被一伙号称是边境王护卫队的家伙们给绑架了。故事的主人公，可米和他的伙伴们巧遇了这场绑架事件，可米他们勇敢 幸福小镇剧照(20张)的保护村长，可还是因为战斗力太弱只能眼睁睁地看着村长被人掳走。可米和小伙伴们决心要把村长营救回来，开始了艰苦的修炼…… （成人版） 旋风岛是可米和他伙伴们的家园，他们平静并快乐的生活在那座岛上。但是这是部热血动画，所以，不可能不发生惨剧——村长被人掳走！村长啊！欠了全村人钱的村长啊！被抓走了钱问谁要啊！！！所以我们拼死也要把村长夺回来！为了房贷！为了涨价！为了孩子能上好的学校！我们，我们必须和边境王战斗到底！就算打不过，就算被打倒无数次！我们都要再站起来！因为，我们没钱坐车回春岛了啊！ 战斗吧！少年！
世上谁人能不死？任你风华绝代，艳冠天下，到头来也是红粉骷髅；任你一代天骄，坐拥万里江山，到头来也终将化成一抔黄土。故事主要讲述萧晨被皇家天女赵琳儿追杀，意外误入长生界蛮荒龙岛中，这是一条回不了家的穷途，陌路之上困兽和仇人，铺天盖地而来。举目皆敌。对亲友和故乡的眷恋一直支撑他在这异界他乡拼杀闯荡，战异兽，斩仇敌。热血澎湃的战斗，激情与欲望的诱惑，萧晨追寻着长生不死者的足迹，慢慢揭开一个被尘封了无尽岁月的上古神话世界的面纱……
随着武魂融合技的锋芒消散，切磋赛最终以唐舞麟所带领的一年级组获胜而告一段落。片刻宁静后，一年级生们的期末考试也如期而至。学院提出的种种难题令众人捉襟见肘，唐舞麟等人也不例外。他们使出了各自的看家本领，为通过考试，跌跌撞撞的踏上了明都之行……
