地球附近的一个异空间中有一个酷宝王国，酷宝以人类情绪波动时散发的情感核能为食物。情感核能分两种，开心、欢乐时产生的情感核被称为七彩元动能，相反悲伤、痛苦产生的是黑色邪动能。女魔头阿酷波斯，率领叛军企图推翻酷宝国王的统治，并通过时光机逃到了20年前的人类世界，企图影响未来人类世界的快乐领袖——司徒乐的成长，让他容易产生邪恶的念头和情感，为阿酷波斯提供庞大的黑色邪动能，征服酷宝王国。酷宝国王得知阿酷波斯的计划，便派小宝前往过去的人类世界保护幼年的司徒乐。
1800年的日本，活跃着一位头戴黑色假面的男子，他使用着新式的强力武器——“侍铳”。由于他一贯疾恶如仇，所以平民百姓称他为义贼。事实上，他真正的身份是幕府的敌对势力“养成堂”秘密培养的战士，拥有超常的耐力与反应速度。在风云动荡的幕末，在一场场险恶的战斗中，包括主人公在内，所有人的信念都经受着前所未有的考验！
动画剧情紧接《功夫熊猫3》电影，阿宝也作为师傅收下了四个徒弟。 来到生父所在的熊猫村定居后，阿宝收了4个天赋异禀的徒弟女孩(Nu Hai), 宝(Bao), 静(Jing)、饭桶(Fan Tong)，他们分别化身青龙、灵龟、白虎和朱雀，对付新的反派金雕。 4个精力充沛的熊猫宝宝掉到一个山洞里，他们从传说中的“四星象”那里获得了气(chi)，有了成为大侠的基础。当然这4个熊孩子需得到神龙大侠阿宝的指点才能成大器。 影片反派金雕是千年前的武侠宗师，他曾是青龙、灵龟、白虎和朱雀的师傅，但被黑暗气(chi)所诱惑堕入黑暗。“四星象”封印了自己和金雕，没想到千年后金雕跑出来找到秃鹰做肉身。如果金雕将“四星象”吸收，就会变成完全体，天下将毁于一旦。
成年的泰德·天普顿被诬陷参与公司犯罪，于是变回宝贝老板，与哥哥蒂姆一起生活，假扮成他的孩子
那六胞胎在完全新作剧场版中回来了！ 已经超过二十岁却还是废柴尼特处男的松野家六兄弟。 某天在高中同学会中重逢的同学们， 都已经以社会人的身份生活，成为了正经的大人。 自己那无可辩驳的寒碜现状暴露无疑， 六胞胎就这样默默走上归途。 完全失去归所而酩酊大醉，阿松们就这样陷入沉睡。 第二天早晨，醒来的他们眼前出现的景象是……
400年前――魔法士ラナクの裏切りにより魔力を暴走させ、 魔法大国トゥルダールを一夜にして滅ぼしたティナーシャ。 その忌まわしい過去はオスカーによって改変され、 世界は“青き月の魔女”が存在することのない新たな時を刻み始めた。 ティナーシャはトゥルダールの女王に即位し、やがて長い眠りにつく。 すべての苦しみから自身を救い、愛を告げて消滅していったオスカーと 遠い未来で再び出会うために……。 そして、400年後――書き換えられた世界のオスカーがトゥルダールを訪れる。 目覚めたティナーシャとの間に、共に過ごしてきた思い出は何ひとつない。 消え去った世界で結ばれたことさえ知らぬ二人は、 ここからどんな物語を紡いでいくのか――。
