《女人就是女人》的故事從班長趙凌風（黃家恆飾）開始，凌風學業成績理想並且開始跟同班同學麗淇（麥詠楠飾）交往。可是，凌風卻對自己的男兒身並不自在，並且渴望成為女性，對於性別認同感到困擾，並在一次到麗淇家的過程碰到她的媽媽宋紫洳（李蕙敏飾）。四十歲的紫洳跟丈夫志鴻（鄧汝超飾）結婚十多年，跟丈夫與前妻所生的女兒關係良好。可是，志鴻卻無意發現了紫洳是跨性別人士，無法接受現實，並令家庭瀕臨破裂。

　　电影分为三个故事。
　　《鬼屋》：小周（思维 饰）、小李（王钟 饰）和小王（刘陆华 饰）三人初生牛犊不怕虎，竟然决定到一间传闻闹鬼的屋子里待上一夜，哪知道正是这一夜，让他们的人生走上了无法逆转的悲剧道路。
　　《白骨无情》：张松根（林伟图 饰）的母亲（红薇 饰）去世了，临死前，她告诉儿子自己会回到他身边陪伴他。果不其然，之后的每一天，张松根都能在家中看到母亲的鬼魂。
　　《古之色狼》：书生宋礼和老管家结伴上京赶考，哪知道宋礼好色的习性不改，非要留宿于墓地之中期盼能够遇见美艳女鬼，可惜女鬼没遇到却遭到了一顿毒打。之后，宋礼又遇见了砍柴人，哪知道砍柴人貌似忠良无害，却是取人性命的僵尸。

　　美国著名物理学家查理，带着妻子安妮与儿子杰克来到中国广西旅行，在一次意外事故中，儿子掉落山谷与父母失散。杰克在森林里遇到森林守护者小健等人，他们都有一身好功夫与求生技能，于是他们带领杰克走出山林回到父母身边。

　　冼齐（沈威 饰）在无意之中救了商业大亨丁志雄一命，为了报答冼齐，丁志雄决定雇佣他为自己的保镖。丁志雄的妹妹阿碧对冼齐一见钟情，对他展开了热烈的攻势，这让阿碧的男友头马感到非常的不爽，为了出掉冼齐，头马设计了一个阴谋想要陷害前者，幸运的是，丁志雄的老婆丁太太聪慧的识破了头马的诡计，让冼齐逃过了一阶。实际上，冼齐早已经深深的爱上了成熟温柔的丁太太。
　　在一次偶然之中，冼齐邂逅了名为欣欣的女子，很快就和热情开朗的她打得火热。哪知道这个女人差点要了他的命。原来，欣欣的叔父是丁志雄的生意伙伴，同时也是不共戴天的仇敌。

　　九十年代，东北小城，年轻工人关键（庹宗华 饰）到公安局检举自己母亲是杀人犯，揭开一段尘封往事。天寒地冻的东北小村庄，关键家里母亲（斯琴高娃 饰）做豆腐卖豆腐，父亲（马精武 饰）在当地小学做校长，表面威严正义，在家却对妻子儿子粗鲁打骂。任劳任怨忍气吞声的母亲，在一场意外中认识了林场工人刘大贵（巍子 饰），大贵和母亲慢慢熟悉，让母亲体会到从父亲那里无法得到的男人关怀，二人成了情人。纸包不住火，二人关系街谈巷议，关校长察觉后对母亲抱以变本加厉毒打，令母亲产生杀心，她在丈夫食物中投毒，被儿子关键看到。暴躁的父亲死了，关键某种程度上也松了一口气，但母亲投毒的画面总在心中郁结，令他无法正视她的改嫁，经过近十年的思想斗争，他终于做出状告母亲的决定……

　　警方发现了一具女尸，而且被肢解。陈Sir怀疑是谋杀，于是安排手下阿雄协助调查，在警方开始调查的同时，凶手再次作案......

　　一批不同地域不同背景的大陆人在九七之后各怀心事来到香港，现实的困顿令他们游走在城市的边缘，只能做香港城的弃民，眼见的繁华宛如无法碰触的美丽梦境。
　　阿英（王宁）是持短期护照的妓女，深陷在本可当驻港解放军但不幸死去的男友的回忆里，将卖淫当作一种迅速捞钱的手段。阿燕（吕丽萍）曾是舞蹈老师，一场车祸令她失去跳舞的能力和儿子，到港后只能在酒楼当电梯小姐，光辉与凄惨的对照令她把自己锁起。阿健（梁家辉）是阿燕的同居男友，靠经营一家色情录像带店过活，生活对他只是混日子，因此同阿燕在一起也只是求生活上有个依靠。“排骨仔（周智生）”是电梯维修员，沉默内向，生活的枯燥乏味令他沉迷于电台call-in和色情场所中，别无他好。