《女人就是女人》的故事從班長趙凌風（黃家恆飾）開始，凌風學業成績理想並且開始跟同班同學麗淇（麥詠楠飾）交往。可是，凌風卻對自己的男兒身並不自在，並且渴望成為女性，對於性別認同感到困擾，並在一次到麗淇家的過程碰到她的媽媽宋紫洳（李蕙敏飾）。四十歲的紫洳跟丈夫志鴻（鄧汝超飾）結婚十多年，跟丈夫與前妻所生的女兒關係良好。可是，志鴻卻無意發現了紫洳是跨性別人士，無法接受現實，並令家庭瀕臨破裂。

　　冼齐（沈威 饰）在无意之中救了商业大亨丁志雄一命，为了报答冼齐，丁志雄决定雇佣他为自己的保镖。丁志雄的妹妹阿碧对冼齐一见钟情，对他展开了热烈的攻势，这让阿碧的男友头马感到非常的不爽，为了出掉冼齐，头马设计了一个阴谋想要陷害前者，幸运的是，丁志雄的老婆丁太太聪慧的识破了头马的诡计，让冼齐逃过了一阶。实际上，冼齐早已经深深的爱上了成熟温柔的丁太太。
　　在一次偶然之中，冼齐邂逅了名为欣欣的女子，很快就和热情开朗的她打得火热。哪知道这个女人差点要了他的命。原来，欣欣的叔父是丁志雄的生意伙伴，同时也是不共戴天的仇敌。

　　警方发现了一具女尸，而且被肢解。陈Sir怀疑是谋杀，于是安排手下阿雄协助调查，在警方开始调查的同时，凶手再次作案......

　　刚刚回归后的香港，经济时局不断转变，黑帮势力也在默默转型，正一步一步把香港变成国际犯罪之都。

　　一代歌后姚小蝶（刘雅丽 饰）自加拿大返港，准备在即将拆除的丽花皇宫进行一场纪念演出，这里是当年她和露露（罗冠兰 饰）、莲茜（冯蔚蘅）、凤萍（苏玉华）三名姐妹歌唱事业起步的地方。六十年代，东南亚的战争阴云对香港也多有波及，此时的四姐妹在丽花皇宫刚刚开始自己的演唱之路，凤萍被烂赌的男友拖累，有孕在身却经常入不敷出，最后消失在混乱的南洋，为四姐妹无忧无虑的日子画上了句号。小蝶属意乐队萨克斯风手家豪（吴大维 饰），但后者意识到小蝶的前途会远比自己灿烂，遂留下一曲《我和春天有个约会》，消失在茫茫人海……
　　本片根据香港话剧团名剧改编，演员基本由原版话剧班底组成。

　　那年盛夏，少女夏文萱（许恩怡 饰）与少年苏升华（陈卓贤 饰），因一张唱片相遇，但对这段青涩的爱情，不知能走多远……
　　多年后，已成为音乐人的苏升华（郑伊健 饰），在人生低谷时，意外重逢夏文萱（蔡思韵 饰）。被病困的夏文萱心痛眼前苏升华变化如此，决定为他送上最后礼物，希望这段旅程能让他找到人生改变……

　　天水围的中学生何灵杰（邓德保 饰）生活在一个问题家庭：母亲精神有障碍，父亲嗜赌又暴力，弟弟两年来下落不明。警方突然到学校拜访何灵杰，带来了弟弟何俊杰（黄溢豪 饰）杀人后又自杀未遂的消息。古惑仔拗柴令人威胁何灵杰交出弟弟偷走的毒品，何灵杰由此与弟弟的同伴白木和鸡子结识。在纷乱的校园中只顾读书的何灵杰从来不曾为遭受殴打的弟弟出头，弟弟离家后的两年中过着怎样的生活他也一无所知。何灵杰拜访白木和鸡子，打听弟弟的经历，原来当年在街头游荡的何俊杰偶然结识白木等人，不甘再次受辱的俊杰奋起反抗，反而与白木一伙结为朋友。从此这班天水围少年入室偷窃、纵情狂欢，直到某日古惑仔拗柴将他们纳入了自己的势力。俊杰在童党混乱的生活中渐渐迷失，慢慢向未知深渊滑落……

　　神偷容碧华乘乞儿会卖武时向旁观者施以空空妙手, 情贼林英伟亦被盗去银両, 乞儿会不甘被捣乱, 与华结怨. 伟跟踪华返家, 得悉华与舅父卜大豪欲盗取龙员外的御赐宝玉, 为免宝玉落入他们手中, 伟抢先将宝玉盗去, 再物归原主, 龙小姐因而对伟倾慕不已. 华与乞儿会的麻面婆狭路相逢大打出手, 伟助麻脱险, 与乞儿会中人结为知交. 伟为替乞儿会筹募经费, 假意向豪兜售宝玉, 二人谈不拢, 展开恶斗, 伟误堕豪机关...... (续下集大结局)

　　狄龍移居加拿大後, 落地生根. 育有一子一女, 但因與妻婚姻破裂, 狄龍父兼母職, 照顧一對年幼子女. 鄰居住有一對父女, 父親谷峰脾氣暴躁古怪. 養女梁婉靜, 侍父至孝. 狄對梁頗有印象, 暗戀多時, 惜梁始終未覺. 狄為了與老父張瑛團聚, 因此安排張到加拿大安享晚年. 不料, 在谷峰父女設宴為張洗塵時, 發覺張乃當年之情敵. 自此之後, 兩人終日鬥氣, 勢成水火. 狄, 梁二人雖無法平息兩老之爭鬥, 但卻造就兩人更多接觸及互相了解之機會. 不久梁接受了狄之示愛, 惟兩老極力反對, 谷峰父女更大吵一場, 最後谷竟趁風雲之夜失踪, 一幕雪地尋人的風波因而展開......

　　1999年，澳门回归中国前。澳门司警马振成（杜汶泽饰）因惹上是非遭停职，警察生涯即将终结。马振成与伙计仍然夜蒲，盲打误撞遇上一名神秘少女张碧欣（梁洛施饰）。张碧欣随之跟着马振成回家，醉酒醒来的马振成以为自己与对方有了一夜情，再加上碧欣声称是他与初恋情人分手后生下的女儿，更加令马振成错愕不已。
　　碧欣因欠租数月以致无家可归，其心爱的狗狗伊莎贝拉亦被无良业主赶走，下落不明。身为父亲的马振成希望能弥补以往的责任，其后碧欣坚决要与马振成同住，令一向放浪的马振成生活顿起变化。
　　为求自保，马振成企图以身犯险令自己得以脱罪，他的好友杜Sir（黄秋生饰）亦屡劝无效。张碧欣欢欣鼓舞地准备与父亲落草，对着同校男生也难掩得意之色。然而渐渐地马振成从张碧欣身上，体会到什么是责任。