1948年的深冬，作家（姜文）在41岁生日的晚上收到一封厚厚来信，此信出自一个濒死女人之手，所言是她对他将近20年的爱恋，但他却一无所知。
　　18年前，13岁的女孩爱上了住在隔壁的作家，因家变搬到了别处后，女孩并没对作家忘情。几年过去，女孩变成女学生（徐静蕾）回到原来的住处，如愿以偿与作家有了交往，但作家对眼前曾住在其隔壁的女学生没有任何印象。作家有事离开，自此音信全无，女学生在绝望的等待中生下她与作家的结晶，并为让孩子过上优越生活变作依附有钱男人的交际花。又过几年，女学生变成女人，再遇她深爱多年的作家时，对方仍没把她认出。

　　聋人小马 （张艺兴 饰）和女儿木木（李珞桉 饰）彼此为伴，小孩姐木木是家里的“顶梁柱”，替爸爸和外界沟通，帮爸爸接活赚钱。然而随着木木的长大，她必须要融入听人的世界，两人形影不离的生活即将被打破。就在此时，一个专门利用聋人犯罪的团伙盯上了小马，爱女心切的他一步步被骗入了犯罪的深渊.....

　　蓝冰（蓝飞洋 饰）拥有英俊的外表和一身撩妹的本领，因此成为了PAU学导师。一次偶然中，蓝冰邂逅了名为臻秋的女孩，实际上这并不是两人第一次见面了，只是臻秋似乎早已经将蓝冰忘在了脑后。蓝冰想方设法得到了臻秋的电话号码，对她展开了热烈的攻势。
　　臻秋在大学时代曾经有过一段非常糟糕的感情经历，这段经历彻底的改变了她的性格，让她对所有异性都敬而远之。不仅如此，她还积极的帮助自己身边的同性好友们，教她们如何识别渣男抵挡PAU学，但随着时间的推移，臻秋还是抗拒不了蓝冰的热情，心情渐渐动摇。臻秋的动摇直接导致了她的闺蜜惨遭欺骗。

　　四十年前，李美松（王洪光 饰）当上了家乡的护林员。美丽的村姑爱上了看上去又憨又傻的护林员李美松，精明霸气的青年张雄（刘景范 饰）感到愤愤不平。李美松几十年如一日，拿着微薄的工资，守护着这片山林，跟张雄等想毁林发财的人做着各种斗争。进入老年的李美松和张雄仍然明争暗斗，恶势力看似在表面上占了上风，但最终张雄的淫威仍屈服在李美松的凌然正气前面。而李美松的宽容与大度，也彻底化解了张雄数十年的积怨，使他再出狱后成为了一名企业家，并且分享着森林给予的恩惠。
　　《疙瘩爷爷》由发生在重庆巫山地区的真实故事改编而成，其中李美松的原型叫李美成，2007年被评为“感动重庆十大人物”。从1966年开始，李美成开始守护当地的500亩山林，10000余株古树，从24岁一直守到60多岁，默默无闻，40年的总收入只有3100元。在他的守护下，山林被完好保存下来。这个小人物的故事经媒体报道后，立即引起广泛关注，多个部门给予李美成奖励。《疙瘩爷爷》由李美成的故事改编而成，借以向这位坚守承诺四十余年的小人物致敬。而本片也是资深制片人、导演齐为民在《考试》、《夏天有风吹过》、《道歉》以及《派饭》等教育题材影片之后，首次转型，尝试小人物题材。
　　影片大部分以主人公李美松的对立面，存心想砍树发财的村民张雄的视角来进行叙述的。在张雄的眼中，李美松是一个又傻又倔，还不懂得人情世故的笨蛋。但就是这样的人，却让他彻底屈服了。用张雄的话说，“我把他打成残废，他把我送进监狱，我却不得不佩服他。”坏人、恶人在正义和真理的力量面前低头，这也把主人公的人格力量更充分地展示了出来。《疙瘩爷爷》的故事发生地在长江三峡边上的巫山，全片通篇笼罩在苍翠欲滴的青山、峡谷、碧水、丛林之间，水的秀美和山的刚毅，林木的挺拔和人性的敦厚，也传达着人与自然和谐相处之美。