明治维新运动后十二年，日本迎来了新时代。曾经叱咤风云的刽子手绯村剑心如今已成为和平主义者，与朋友们一起在东京过着平静的生活。一天晚上，剑心最喜欢的餐厅遭到炮火袭击，只留下一张写着“人诛”的字条——有人准备替天行道，审判之日近在眼前。此人名为雪代缘，对剑心怀恨在心，带着一众手下前来复仇。目睹无数无辜之人被牵扯进这场残酷的斗争，剑心终将面临一场审判，并由此找到对过去的救赎。

　　小さな都市の工場街、叩きつけるロック調バラードにのせて飛び跳ねるように歩いている非行集団“ペリカン・クラブ”の会員たち、ガニ新(藤竜也)、デボ(前野霜一郎)、C子(梶芽衣子)、ジロー(夏夕介)そしてリーダー格のタキ(地井武男)の姿があった。街にはこのグループに対抗して中年いざこざを起こす“西部会”があり、主導権を争っていた。ある日、白馬にのった美女がタキたちの前に現れた。各地に数十万の信者をもつ正教学会の幹部・藤森信介の2号のアサ子(范文雀)で、タキに近づいたのは何か魂胆があってのことだった。そんな頃グループの一人であるデボは毎夜のごとく、高校の校庭を掘り起こしていた。この校庭には以前、戦争で使用した軽機関銃と拳銃がどこかに埋められているとのことだった。グループの皆からバカにされながらも掘り続けていたのだが・・・。

　　“你是否拥有成为勇者的资格”——自称“宇宙贤者”的神秘男子“萨斯卡尔”对主角优马说的这句话，就是这场战斗的开始。他对优马施加了超乎想象的终极考验。“如果你失败了，将会失去亚刻的力量……”
　　以怪兽防灾科学调查所“SKIP”成员的身份守护星元市的和平、聚集在“SKIP”的同伴们建立起来的信赖纽带、打败怪兽的意义……这些纠缠在一起，而正是因为获得了能够变身为奥特曼的光，现在又被萨斯卡尔玩弄于股掌之间，优马只能独自承受接二连三来到的沉重使命!
　　狂暴的大怪兽们、邪恶的外星人，在连时空都被扭曲的超次元中，黑色的亚刻奥特曼——“基尔亚刻”出现了。
　　优马——亚刻奥特曼究竟能否战胜超越“想像力”的终极考验，守护未来呢? !

　　日本室町时代中叶，当权的幕府威信锐减。野心勃勃的醍醐景光（中井贵一饰），为了成就霸业，而将尚未出生的儿子百鬼丸献祭给48个魔神，他和妖怪定下约定，取走了包括眼、耳、口、鼻等在内的48个器官。
　　一出生就缺少器官部位的百鬼丸，被抛入河中，后来为医生养父（原田芳雄饰）所救，替他制作了义眼、义肢等补足了身上缺失，并命名为百鬼丸（妻夫木聪饰），抚养他长大。为了摆脱自己被诅咒的命运，夺回身体的每一个部分，百鬼丸向占有自己器官的48个魔神宣战，离家踏上征战之旅。
　　在寻找魔神的旅途上，百鬼丸遇到了自称“侠盗”的多罗罗（柴崎幸饰），为了得到百鬼丸手中的宝剑，多罗罗跟随他一起踏上旅程。

　　自幼希望成为黑社会的石川力夫（渡哲也 饰）1940年加入河田组。石川为组织之壮大卖命打拼，但也因其狂暴激进的脾气而始终不得重用，心存愤懑。
　　战后，石川与在北海道狱中结识的好友今井幸三郎（梅宫辰夫 饰）向中国帮派发起进攻，战争中石川结识酒肆侍女地惠子（多岐川裕美 饰）。凭借警方纵容，今井接管中国人赌场，成立今井组。石川刺伤池袋亲和会成员，两派剑拔弩张，河田组长出钱请美国人干预摆平。不久石川因受训斥，炸毁河田组上层领导野津幸三郎（安藤升 饰）之坐驾，接二连三祸事令河田对石川大加挞伐。石川酒醉后刺伤组长，犯黑帮大忌，被黑社会逐出东京10年。于大阪染上毒瘾的石川一年后返回东京，受河田压力的今井与石川关系破裂，石川将枪口对准了昔日结拜兄弟的胸口……