自从七原秋也与中川典子从新世纪教育法（简称BR）中逃出，两年转眼就过去了。人类社会进入了恐怖主义时代！首都在反BR国家的恐怖分子的袭击下，化为一片废墟。政府当局认定凶犯为七原秋也，开始了对其国际通缉。 七原作为反BR组织“wild seven”的精神领袖，对所有成人发出 了宣战通告。成人为了剿灭七原，发起了一个新游戏——BR2。又一个高中班被军队绑架到荒岛，他们无一例外地被勒令换上军队制服，稍有不从下场就只有死亡！又一场血腥、残忍、惨无人道的大逃杀开始了！
　　本片为《大逃杀》的续集，导演深作欣二在开机伊始便病倒，不久病故，其后的拍摄工作由他的儿子深作健太担任。

　　鸦片战争前夕，大侠黄飞鸿（王珏 饰）协助钦差大人林则徐（鲍方 饰）查禁鸦片。十二贝勒（熊欣欣 饰）勾结烟商决定亲自来广州对付黄林二人。广东富商苏仁（吴孟达 饰）的儿子苏灿（甄子丹 饰）武功了得，苏灿的女友戴懿德（袁洁莹 饰）刚从国外回国，遭到火莲教袭击，苏灿为救女友用巨型炮仗炸毁了太平鼓还伤及了无辜。黄飞鸿得知此事后找到苏灿理论，苏灿对黄不满矛盾由此而生。十二贝勒知道两人不和趁机挑拨，想利用苏灿对付黄飞鸿。暗恋苏仁的小姨峭牙珍（陈淑兰 饰）因为误会率领众人去破坏戴懿德的妇女会，与此同时戴发现了十二贝勒的阴谋，但反被十二贝勒抓住，苏灿为救戴被十二贝勒擒住，还让苏灿染上了毒瘾。受到挑拨之后的苏灿前去行刺林则徐，与黄飞鸿发生打斗，戴懿德终于出现说明了真相，苏灿懊悔不已一蹶不振。幸亏老乞丐（关海山 饰）出现帮助苏灿戒毒成功，在千军一发之际苏灿出现帮助黄飞鸿制服了十二贝勒。

　　1944年，二战已经接近尾声，穷途末路的德国纳粹变得格外残忍，众多盟军士兵在缴械后惨遭杀害。美军士兵迪克（Corbin Allred 饰）、斯蒂文（Alexander Polinsky 饰）、谢尔（Larry Bagby 饰）和戈登（Peter Asle Holden 饰）四人从纳粹的屠杀中侥幸逃脱，曾经在德国担任神父的迪克通晓德语，加之出色的枪法令他成为四人中颇为依赖的战力，然而此时的迪克身陷厌战症的困扰，频频出现在眼前的黑影不知是敌人的身形还是死神的召唤？四人在暂时栖身的木屋中恰巧听闻了德军的情报，于是赶在德军之前救出了一位英军飞行员温利。温利身负传递德军布阵情报的重要使命，为了让情报顺利传达挽救盟军将士生命，迪克等四人与温利一同踏上穿越德军封锁线的征途……

　　美国内战结束的十年后，当年的南北战争英雄纳森（汤姆•克鲁斯 Tom Cruise）因无所事事而终日酗酒。一次偶然的机会，他结识了来美做生意的日本商人。纳森的彪炳战绩令对方刮目相看。此时正值明治维新时期，日本天皇意欲训练一支现代化的作战部队，于是纳森被请到了日本。
　　日本很 多武士都不欢迎纳森的到来，他们坚决不肯抛弃传统的武士道精神，对将武士西化十分反感。他们在首领乌吉奥（渡边谦 饰）的带领下举刀起义，躲到了一条偏僻的小山村自立为政。天皇大怒，派纳森率领他训练出来的现代化军队去围剿叛变武士。岂料皇军全军覆没，纳森亦成为了阶下囚……